色谱技术实质上是一种物理化学分离方法，即当两相作相对运动时，由于不同的物质在两相( 固定相和流动相)中具有不同的分配系数(或吸附系数)，通过不断分配( 即组分在两相之间进行反复多次的溶解、挥发或吸附、脱附过程) 从而达到各物质被分离的目的。色谱技术已经发展成熟，具有检测灵敏度高、分离效能高、选择性高、检出限低、样品用量少、方便快捷等优点，已被广泛应用于食品工业的安全检测中。色谱中常用的方法有气相色谱法、高效液相色谱法、薄层色谱法和免疫亲和色谱法。
　　气相色谱法能够准确、灵敏地进行快速定性与定量分析，在食品安全检测中广泛的应用于天然毒素、农药、食品添加剂、兽药等的检测。薄层色谱法(thin-layer chromatography)是20 世纪30年代发展起来的一种分离和分析方法。仪器操作简单、方便、应用广泛，但灵敏度不高。薄层色谱广泛的应用于农药、毒素、食品添加剂等方面，在定性、半定量以及定量分析中发挥着重要作用。质谱分析是一种测量离子荷质比的分析法，质谱作为理想的色谱检测器，不仅特异，而且具有极高的检测灵敏度。色谱与质谱联用技术结合了两者的优点，成为分析化学的研究热点。其中，气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)与液相色谱-质谱技术(LC-MS)应用广泛，前者用于有机物的定性定量分析，后者通常用于极性较大，热稳定性强、难挥发的样品分析。